Leczenie kanałowe pod mikroskopem stomatolog endodonta wykonuje z reguły w najcięższych sytuacjach. Z reguły leczenie kanałowe konieczne jest w momencie, kiedy miazga zęba została mocno zepsuta przez bakterie i próchnicę, dlatego ząb niszczy się dogłębnie. Zazwycza przyczyną przeprowadzanego w klinice dentystycznej zabiegu endodontycznego są również zgorzele i martwica miazgi zęba oraz zmiany zmiany przy wierzchołku, głębokie starcie lub obumarcie zębów. Niekiedy leczenie kanałowe należy wykonać, kiedy np. z powodu urazu dochodzi do odsłonięcia miazgi zęba.
Są jednak tego rodzaju przypadki leczenia kanałowego, co nie wynikają z urazów i chorób. Dla przykładu to może być błędnie przeprowadzony uprzednio zabieg, po którym w kanale zębowym utkwiło złamane narzędzie dentystyczne. Lekarz endodonta musi zadziałać też w przypadku niedrożności kanału. Zablokowanie zwykle występuje na skutek zrośnięcia się lub zwężenia kanałów, skomplikowanego przebiegu lub ze względu na jego nieodpowiednie wypełnienie. Zdarza się, że zabieg endodontyczy potrzebny jest też po zdjęciu wkładu korzeniowo-koronowego.
Leczenia endodontycznego nie trzeba się bać, bez względu jaki to problem, z jakim pacjent zgłasza się do dentysty . W nowoczesnej stomatologii w sumie każdy zabieg dentystyczny wykonywany jest pod znieczuleniem, z uwagi na to zabiegi zupełnie nie bolą. Zdecydowanie lepiej zgłosić się do stomatologa, aby coś poradził i przeprowadził potrzebne zabiegi, niż pozwolić na dalszy rozwój problemu.